Cursos de Introducción a la Genómica Microbiana y Metagenómica

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Código del Curso

mgmint

Duración

21 horas (usualmente 3 días, incluidas las pausas)

Requerimientos

No hay preparaciones especiales necesarias para este curso aparte de la familiaridad con conceptos biológicos generales y un interés en aprender el análisis de los datos de secuencias de ADN para la genómica microbiana.

Descripción General

Este curso proporcionará una introducción a la genómica microbiana. El contenido está destinado a proporcionar un entrenamiento práctico básico sobre análisis de datos, herramientas y recursos para bioinformática microbiana y metagenómica.

¿A quién se espera asistir?
Microbiólogos, profesores, postdoctorandos, estudiantes de postgrado, investigadores e investigadores interesados en la genómica microbiana.

Formato del curso
Los temas se entregarán utilizando una mezcla de conferencias (20%), sesiones prácticas (60%) y discusiones abiertas (20%).
El trabajo práctico durante el curso utilizará pequeños conjuntos de datos de ejemplo, pero es posible trabajar con sus datos personales.
Este curso se llevará a cabo en un laboratorio de computación, que tiene computadoras de escritorio con sistema operativo Microsoft Windows con conexión a Internet de alta velocidad. Sin embargo, puede utilizar su propio ordenador portátil, sólo asegúrese de tener Chrome o Firefox y tener una versión reciente de Java instalado.

Programa del Curso

El curso destacará los principales recursos, enfoques y metodologías basados en la web para el análisis de datos de secuencias de ADN para la genómica microbiana.
Los temas principales a ser cubiertos incluyen:

  1. 16S / 18S metagenómica e identificación de especies.
  2. Multi locus secuencia de mecanografía.
  3. SNPs y perfiles de plásmidos.
  4. SNPs basado filogenia.
  5. Predicción del mecanismo resistente a los antibióticos.

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